Un instrument spécifique est utilisé pour achever les Réseaux transeuropéens de transport (RTE-T) identifiés par le Conseil et le Parlement européen. Les réseaux de transport bénéficient d'un financement pluriannuel dans le cadre d'un réglement régissant le financement de ces réseaux entre 2007 et 2013.
Le 24 mai 2006, la Commission Européenne a adopté le budget pour la période 2007-2013 qui s'élève à 8,013 milliards d'euros pour les RTE.
Les sous programmes européens :